พิพิธภัณฑ์ที่มหาวิทยาลัยฮอกไกโดมาจากการซื้อพิพิธภัณฑ์สวนพฤกษศาสตร์ซึ่งบริหารและดำเนินการโดยผู้บุกเบิกในปี 1884 (เมจิ 17) ในยุคสมัยของโรงเรียนเกษตรกรรมซัปโปโร ปัจจุบันพิพิธภัณฑ์พิพิธภัณฑ์สวนพฤกษศาสตร์อยู่ภายใต้การดูแลของศูนย์วิทยาศาสตร์สนาม Biosphere ภาคเหนือของมหาวิทยาลัยฮอกไกโดและเป็นองค์กรที่แยกต่างหากจากพิพิธภัณฑ์ทั่วไป

การตรวจสอบการติดตั้งของพิพิธภัณฑ์ทั่วไปในวิทยาเขตซัปโปโรเริ่มต้นในปี 1966 (Showa 41) และการติดตั้งได้รับการยอมรับจากกระทรวงศึกษาธิการในปี 1999 (Heisei 11) หลังจากความคิดที่ครอบคลุมประมาณ 30 ปี

พิพิธภัณฑ์ทั่วไปมีวัตถุประสงค์เพื่อรวมและจัดการให้อยู่ในสภาพที่ดีตัวอย่างทางวิชาการที่ผลิตขึ้นเป็นผลการวิจัยเป็นเวลา 140 ปีนับตั้งแต่เปิดโรงเรียนสอนการเกษตรซัปโปโร

พิพิธภัณฑ์ทั่วไปในฐานะหน่วยงานภายในเป็นอาคารหลัก (เหนือ 10 บทความตะวันตก 8 chome) ในวิทยาเขตวิทยาเขตซัปโปโร, ซัปโปโรหมายเลข 2 ฟาร์ม (18 เหนือ 18 บทความทิศตะวันตก 8 ชุม), และพิพิธภัณฑ์วิทยาศาสตร์การประมง (เมืองท่าเรือฮาโกดาเตะ) เมืองฮะโกะดะเตะ ประกอบด้วย 3 สิ่งอำนวยความสะดวก